私立崇先中學1968年至1970年間曾經接受台灣省政府教育廳徵用為代用國中。

1993年起，董事長李聰田與其他十多名董事，共同掏空校內資產1.6億元。 2003年12月經台灣雲林地方法院檢察署檢察官徐維岳指揮檢調單位調查此案，於2004年3月將該校董事會包括李聰田在內的8名成員分別依偽造文書、業務侵占等罪名起訴。 其後，崇先中學經營日漸困難，2005年已無法發放教師薪水，並且停開學生專車、午膳廠商停止供食，甚至有斷水斷電之虞。 94學年度開學時，學生數200人，至9月中僅剩65人。 同年輔導學生轉學後，崇先中學廢校。