健行科技大學前身為創立於民國五十五年的健行工業專科學校。創校之初設有土木工程、電訊工程、建築工程及工業管理等四科六班，經逐年擴展，於83學年度奉準改制為健行工商專科學校。隨後為配合技職教育變革及自我提升，民國88學年起教育部核准改制為健行技術學院；除原有專科部6科外並成立學院部及進修部，設電子、電機、機械6系，同時奉準附設專科進修學校，設有工業工程與管理及國際貿易2科。民國89年1月奉準更名為清雲技術學院，90學年度新增企管、行銷、資管、財金等10系；91學年度增加資工及應外系，總招生系所增為12系；學制計有二技、四技日夜間、在職班、在職專班及二專日夜間、在職班、進修學校等。 91、92學年度陸續成立機械、電子、電機研究所；92學年度奉準改制為清雲科技大學；93學年度成立經營管理研究所、土木與防災研究所；94學年度新增國際企業管理研究所、中亞研究所；95學年度土木與防災研究 所更名為“空間資訊與防災科技研究所”；96學年度新增國際企業管理研究所在職專班、應用空間資訊系、物業管理學位學程及材料製造科技學位學課程；97學年度新增資訊工程研究所及資訊管理研究所；98學年度新增財務金融研究所；100學年度物業管理學位學程更名為物業經營與管理系，並新增餐旅管理系。 101年8月奉準恢復校名為健行科技大學。至102學年度止，本校合計有15個系、1個學位學程、13個碩士班。本校創校近50年，培育術德兼備之有為青年無數，在董事會及歷任校長領導擘劃下，不斷增建校舍，充實設備，延攬優秀之國內外學人來校執教，加強師資陣容，期能質量兼顧，開創宏觀的新紀元。因此本校中程校務發展計畫，依據辦學理念與願景，擬定發展目標與策略，藉由落實各項計畫，發展學校特色 與優勢，在教學、研究、輔導及校務行政的推動上，結合校訓“好學有禮”，並形塑“有禮”的校園文化，讓健行科技大學成為教職員工的幸福職場，以身教及境教培養學生的職場倫理與工作態度，並發展成優質的一流大學。